В соответствии с пп. 2, п. 5, ст. 346.5 НК РФ, расходами налогоплательщика признаются затраты после их фактической оплаты.

В целях настоящей главы оплатой товаров (работ, услуг) и (или) имущественных прав признается прекращение обязательства налогоплательщика - приобретателя указанных товаров (работ, услуг) и (или) имущественных прав перед продавцом, которое непосредственно связано с поставкой этих товаров (выполнением работ, оказанием услуг) и (или) передачей имущественных прав.

При этом расходы учитываются в составе расходов с учетом следующих особенностей:

материальные расходы, в том числе расходы на приобретение сырья и материалов (включая расходы на приобретение семян, рассады, саженцев и другого посадочного материала, удобрений, кормов, лекарственных препаратов для ветеринарного применения, биопрепаратов и средств защиты растений), а также расходы на оплату труда учитываются в составе расходов в момент погашения задолженности путем списания денежных средств с расчетного счета налогоплательщика, выплаты из кассы, а при ином способе погашения задолженности - в момент такого погашения. Аналогичный порядок применяется в отношении оплаты процентов за пользование заемными средствами (включая банковские кредиты) и при оплате услуг третьих лиц;

При начислении арендной платы осуществляются записи: Дт 20 - Кт 76, так как пайщики не являются плательщиками НДС, то обязанность по выставлению счета-фактуры у них отсутствует, то есть аренда земельных участков принимается в расходы без НДС в полной сумме проводки Дт 20 - Кт 76, однако в ЕСХН расходы принимаются по оплате (при выплате натурой, в бухгалтерском учете осуществляются записями Дт 76 Кт 90-1, Дт 90-2 Кт 10, 11, 41, 43 и Дт 90-3 Кт 68-2).

Таким образом, на 20 счет арендная плата приходит без НДС, значит оплата кредиторской задолженности в полном объеме будет включаться в расходы. В данном случае не нужно обращать внимание на то, что продукция, реализуемая в счет оплаты аренды, облагается по ставке 10 % НДС. Как Вы верно отметили, доходы, учитываемые при исчислении налоговой базы сумма выплаченной арендной платы в натуральном выражении, принимается без НДС. То есть НДС при реализации продукции в счет натуральной оплаты услуг, влияет только при определении доходов для целей исчисления ЕСХН.