По СБИС (Обмен ЭДО) отправляют документы-сканы подписанные руками - Транспортные накладные и получается утвержденная  ЭЦП. Правильно ли это?

К электронной  УПД прикладывают сканы транспортных накладных...затем оригиналы не отправляют по почте... Можем ли мы в налоговой это оправдать чтоб электронаая подпись на скане документа есть на документы это считается что юридически обоснованным.

Электронный скан документа, подписанный ЭЦП, является  заверенной копией документа. 

При электронном документообороте в электронном виде следует создавать не электронные копии бумажных документов, а именно оригиналы электронных документов.

Первичный учетный документ составляется на бумажном носителе и (или) в виде электронного документа, подписанного электронной подписью (пункт 5 статьи 9 Закона N 402-ФЗ).

Таким образом, для целей налогового учета первичный учетный документ в виде электронного документа должен соответствовать требованиям бухгалтерского законодательства, а также законодательства, регулирующего порядок составления электронных документов и правила их подписания электронной подписью.

Остается обязанность налогоплательщика в дальнейшем предоставлении первичного учетного документа в бумажном или в электронном виде, оформленного в соответствии с законодательством РФ.