По СБИС (Обмен ЭДО) поставщики отправляют документы, сканы,  подписанные руками - Транспортные накладные  и получается утвержденная  ЭЦП. Правильно ли это? К электронной УПД они прикладывают сканы транспортных накладных, а оригиналы не отправляют по почте. Для целей налогового учета электронная подпись на скане документа будет считаться обоснованной?

Электронный скан документа, подписанный ЭЦП, является заверенной копией документа. При электронном документообороте в электронном виде следует создавать не электронные копии бумажных документов, а именно оригиналы электронных документов. Первичный учетный документ составляется на бумажном носителе и (или) в виде электронного документа, подписанного электронной подписью (пункт 5 статьи 9 Закона N 402-ФЗ). Таким образом, для целей налогового учета первичный учетный документ в виде электронного документа должен соответствовать требованиям бухгалтерского законодательства, а также законодательства, регулирующего порядок составления электронных документов и правила их подписания электронной подписью.

Остается обязанность налогоплательщика в дальнейшем предоставлении первичного учетного документа в бумажном или в электронном виде, оформленного в соответствии с законодательством РФ.